Khi nhập khẩu, các doanh nghiệp khai báo giá trị rất thấp, nhưng khi xuất khẩu một số doanh nghiệp khác lại khai báo giá trị rất cao, chênh lệch khoảng hơn 50 lần. Việc này tiềm ẩn nguy cơ rủi ro về việc mua bán hóa đơn, kê khống giá trị hóa đơn trong nội địa để nâng khống giá trị hàng hóa xuất khẩu nhằm chiếm đoạt tiền hoàn thuế Giá trị gia tăng.
Theo Tổng cục Thuế, một số doanh nghiệp có hàng hóa nhập khẩu dù mỗi lô hàng chỉ có trọng lượng vài kilôgam đến vài chục kilôgam nhưng được khai báo trị giá từ vài tỷ đến vài chục tỷ đồng.