TPHCM dự kiến giữ nguyên Trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch và Thủ Dầu Một. Trường Đại học Sài Gòn sẽ được tổ chức lại trên cơ sở sáp nhập với trường Cao đẳng Sư phạm Bà Rịa - Vũng Tàu. Ngoài ra sẽ sắp xếp lại 19 trường cao đẳng khác.