Mặc dù đến nay tổng mức đầu tư của tiểu dự án không thay đổi, nhưng vốn hỗ trợ phát triển chính thức (ODA) giảm trên 13 triệu USD, nên việc thi công các hạng mục hầu hết đình trệ.
Khánh Hòa sẽ sử dụng nguồn vốn ngân sách hơn 575,2 tỷ đồng để tiếp tục triển khai khối lượng còn lại của dự án Môi trường bền vững các thành phố duyên hải – Tiểu dự án thành phố Nha Trang thay cho nguồn vốn vay ODA của nhà tài trợ Ngân hàng Thế giới (WB).