Nếu vi phạm các quy định trong Chỉ thị 16/CT-TTg về phòng, chống dịch Covid-19, đối tượng vi phạm có thể bị áp dụng những mức phạt sau đây:
Trước diễn biến phức tạp của dịch COVID-19, ngày 16/7, Tổng Kiểm toán Nhà nước Trần Sỹ Thanh đã kí ban hành Chỉ thị đề nghị các đơn vị dừng ngay toàn bộ hoạt động kiểm toán đang triển khai và chuẩn bị triển khai tại các đơn vị được kiểm toán có địa điểm thuộc vùng, khu vực, địa phương đang thực hiện Chỉ thị 15/CT-TTg ngày 27/3/2020, Chỉ thị 16/CT-TTg ngày 31/3/2020 của Thủ tướng Chính phủ.
Tổng Kiểm toán Nhà nước Trần Sỹ Thanh yêu cầu dừng ngay toàn bộ hoạt động kiểm toán đang triển khai và chuẩn bị triển khai tại các đơn vị được kiểm toán có địa điểm thuộc vùng, khu vực, địa phương đang phải triển khai áp dụng thực hiện Chỉ thị 15/CT-TTg ngày 27/3/2020, Chỉ thị 16/CT-TTg ngày 31/3/2020 của Thủ tướng.