Trong quá trình quản lý, Công ty Lâm nghiệp Ia H'Drai để người dân lấn chiếm hơn 600 ha đất. Bên cạnh đó, từ năm 2018 đến 2020, đã để xảy ra 34 vụ vi phạm Luật lâm nghiệp với hơn 941 m3 gỗ bị khai thác.
Thanh tra tỉnh Kon Tum giao phòng nghiệp vụ làm thủ tục chuyển hồ sơ sai phạm tại Công ty TNHH MTV Lâm nghiệp Ia H'Drai sang cơ quan CSĐT Công an tỉnh Kon Tum để tiếp tục điều tra, xử lý theo quy định.
Trong vòng 3 năm, Công ty TNHH MTV lâm nghiệp Ia Hdrai đã để xảy ra 34 vụ vi phạm lâm luật với khối lượng gỗ là hơn 941m3.