Nhiều trường hợp học sinh chuyển trường với lý do không chính đáng theo quy định của Bộ GD-ĐT, có trường hợp học sinh điểm đầu vào thấp hơn điểm của trường chuyển tới.
Sở Giáo dục và Đào tạo Thanh Hóa cho rằng, họ là chỉ là đơn vị tham mưu ý kiến cho những trường hợp đặc biệt còn quyết định vẫn thuộc về các trường cho và nhận học sinh trong quá trình luân chuyển.