Đồng Nai hiện đang gặp một số vướng mắc trong bảo vệ, phát triển rừng như: quy định mật độ cây rừng, xác định chủ sở hữu với rừng phòng hộ khi Nhà nước có đầu tư một phần kinh phí, khai thác rừng trồng trong đất tại vùng quy hoạch rừng phòng hộ... Những khó khăn trên nếu chậm tháo gỡ sẽ ảnh hưởng rất lớn đến công tác bảo vệ rừng của tỉnh.