Hiện nay, toàn tỉnh có 2.718 ha nuôi trồng thủy sản, tập trung ở các huyện: Mường La, Quỳnh Nhai, Thuận Châu, Bắc Yên. Năm 2020, tổng sản lượng thủy sản ước đạt 8.194 tấn, tăng 2,35% so với năm 2019 (sản lượng thủy sản nuôi trồng 7.009 tấn, sản lượng khai thác 1.185 tấn).
Những năm gần đây, huyện Mường La đã tập trung thực hiện các chính sách hỗ trợ phát triển nuôi trồng thủy sản trên lòng hồ các công trình thủy điện; đẩy mạnh các hoạt động xúc tiến thương mại, giới thiệu, quảng bá, tiêu thụ sản phẩm thủy sản chế biến. Nhờ vậy, nghề nuôi trồng thủy sản trên địa bàn từng bước phát triển ổn định, hướng tới là ngành kinh tế chủ lực của địa phương.