Theo TS Nguyễn Đình Ninh, công cụ quản lý lĩnh vực nước thuộc quyền quản lý của các bộ khác, vì thế vị thế trong quản lý của Bộ TN&MT rất mờ nhạt.
Tham gia góp ý Luật Tài nguyên nước (sửa đổi), PGS.TS. Lê Bắc Huỳnh cho rằng, phải xác định lại quan niệm về tài nguyên nước như một tài sản công, từ đó quy định lại chức năng của các cơ quan quản lý Nhà nước về ngành này.