Mục tiêu dự án nhằm nâng cấp kênh Mương Khai - Đốc Phủ Hiền đạt chuẩn tắc luồng tàu kênh cấp III - đường thủy nội địa, xây dựng kè bảo vệ bờ chống sạt lở, chỉnh trang đô thị dọc tuyến kênh.