Quá trình triển khai, Dự án Khu CNC sinh học Hà Nội đã gặp một số khó khăn vướng mắc liên quan đến điều chỉnh quy hoạch Thủ đô và quy hoạch phân khu đô thị GS... Đây là nguyên nhân đến nay dự án vẫn chưa được triển khai, xây dựng.
Dự án được phê duyệt từ năm 2006, nhưng đến nay vẫn không triển khai, khiến đời sống của hơn 300 hộ tại khu dân cư Nhuệ Giang bị ảnh hưởng. Cử tri đề nghị UBND TP. Hà Nội xem xét đưa khu dân cư Nhuệ Giang ra khỏi quy hoạch dự án Cụm trường trung học chuyên nghiệp và dạy nghề thành phố.