Theo cơ quan chức năng, TP Cần Thơ hiện còn nhiều doanh nghiệp trong các khu công nghiệp chưa đấu nối hệ thống xử lý nước thải tập trung. Khu vực đô thị, tỷ lệ nước thải sinh hoạt được xử lý ở mức thấp so với nhu cầu thực tế.