Nhuyễn thể 2 mảnh vỏ được nuôi hoặc phân bố tự nhiên ở vùng biển cửa sông, do vậy trong thịt nhuyễn thể còn có nguy cơ chứa các mối nguy: Vi sinh vật gây bệnh dư lượng thuốc trừ sâu, kim loại nặng, PCBs, dioxins, PAH/Benzo(a)pyrene) vượt mức giới hạn cho phép.
Trong tự nhiên, nhiều loài thủy sản, động vật trên cạn và thực vật trên cạn có chứa 'mối nguy gắn liền với loài' gây hại cho sức khỏe người sử dụng.