Lợi dụng chức vụ hiệu trưởng, bà Nguyễn Thị Thu Thủy đã chỉ đạo kế toán lập hồ sơ khống, móc nối với doanh nghiệp để chiếm đoạt tiền của ngân sách Nhà nước. Chỉ trong 3 năm, hàng loạt hợp đồng giả mạo được ký kết, giúp các bị cáo bỏ túi cả trăm triệu đồng vốn dành cho trường học.