Tách ra từ bộ môn bơi - lặn vào năm 2019, hiện nay bộ môn lặn của Thanh Hóa có 4 huấn luyện viên (HLV) và 30 vận động viên (VĐV), trong đó có 12 VĐV tuyến tỉnh, 8 VĐV tuyến trẻ và 10 VĐV năng khiếu. Nổi bật nhất là VĐV Cao Thị Duyên - người đã giành 2 HCV tại SEA Games 31 năm 2022; 3 HCV, 2 HCB, phá 2 kỷ lục tại SEA Games 32 năm 2023 - thành tích cao nhất mà một VĐV Thanh Hóa giành được tại một kỳ SEA Games.
Tại giải Bơi Vô địch quốc gia 2025, đội tuyển Bơi Thanh Hóa giành được tổng cộng 5 huy chương, trong đó Hoàng Thị Trang xuất sắc mang về tấm HCV duy nhất cho đoàn ở nội dung 200m bơi ngửa.
Được kỳ vọng mang lại nhiều huy chương cho thể thao thành tích cao Thanh Hóa tại Đại hội Thể thao lần thứ X, năm 2026, bộ môn bơi đang trong quá trình chuẩn bị tích cực cho sự kiện này. Không chỉ phấn đấu vì mục tiêu thành tích, đây còn là cơ hội để đội tuyển đánh giá lại thực lực, định hướng kế hoạch tương lai.