Do kéo dài thời gian thực hiện dự án nên phát sinh chi phí lãi vay, tổng mức đầu tư tăng từ 9.976 tỉ đồng lên thành 14.398 tỉ đồng. Dự kiến dự án chống ngập tại Thành phố Hồ Chí Minh sẽ thi công trở lại từ ngày 1/6.
Do thi công chậm tiến độ nên Dự án giải quyết ngập do triều khu vực TP.HCM có xét đến yếu tố biến đổi khí hậu, giai đoạn I đang có nguy cơ bị tăng vốn từ mức 9.976 tỷ đồng lên 14.398 tỷ đồng.