Vùng 3 Hải quân được phân công quản lý, bảo vệ vững chắc chủ quyền vùng biển của 7 tỉnh, thành phố duyên hải miền Trung, trong đó có nhiều khu vực đảo và quần đảo tiền tiêu giữ vị trí chiến lược quan trọng.
Để tăng cường lực lượng, đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ bảo vệ vững chắc chủ quyền biển, đảo của Tổ quốc, ngày 26-10-1975, Bộ Quốc phòng ra quyết định thành lập Vùng 5 Duyên hải (tiền thân của Vùng 5 Hải quân ngày nay).